defgf24uw
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Wysłany: Nie 11:50, 13 Mar 2011 Temat postu: HCC转录组学Ñ |
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HCC转录组学分类与基因改变及新的治疗靶点有关
在治疗性基因活性的特异性诱导下,核酶可削弱细胞中目标AFPRNA的表达水平。这些结果提示以AFPRNA为靶点的反式剪接核酶可能是HCC靶向治疗中一种有用的基因水平制剂。HCC转录组学分类与基因改变及新的治疗靶点有关(原载:Hepatology2007Jan;45(1):42-52)肝细胞癌(HCC)是一组在危险因素和遗传改变方面都有差异的肿瘤。我们进一步研究了HCC的转录组学一基因型一表型之间的联系。全球转录组分析已经在57种HCC和3种肝细胞腺瘤中进行,并且通过定量RT-PCR对另外63种HCC进行确认。我们测定了每种肿瘤杂合性的丢失、基因突变、CDH1和CDKN2A启动子的甲基化和HBVDNA拷贝数。无监督的转录组学分析发现了6种HCC的强亚型(G卜G6)与临床和遗传特征相关。G1肿瘤与HBV低拷贝数和在胎肝内表达的基因的过表达有关并且受亲代遗传上的标记所控制。G2包括感染高拷贝数HBV和PIK3CA和TP53突变的HCC。在上述几组中,我们检测到特异性的AKT途径的激活。G3肿瘤我们以TP53突变和控制细胞周期的基因的过表达为特点。G4是一组不同亚型的肿瘤包括TCF1突变的肝细胞腺瘤和癌。G5和G6和导致Wnt途径激活的p一连接素突变强烈相关;特别指出的是,G6肿瘤以卫星结节、Wnt途径的高度激活和E一钙粘蛋白低表达为特征。结论:这些结果拓展了我们关于人类HCC遗传差异的理解并提供了区分肿瘤特异性的标记物。另外,我们的分类还有潜在的治疗性意义,因为50%的肿瘤与WNT和AKT途径激活有关,这有可能成为特异性抑制性治疗的靶点。一种结合到肝细胞癌上的寡肽的鉴定(原载:Oncology2006;71(1—2):136—45)目的:我们进行了一种结合到人类肝细胞癌(HCC)细胞上的小肽的鉴定,目的在于将这种肽应用到未来HCC靶向治疗或影像技术中。方法:在噬菌体随机肽库中,利用生物筛选技术将体外HCC细胞上一种表达结合HCC的肽序列的噬菌体克隆选择出来。采用细胞系的噬斑感染分析和免疫荧光法对选择的噬菌体的结合活性进行评估。另外,使用来自经过肝切除术患者的HCC标本来研究表达肽的噬菌体结合活性。结果:一种七肽:Thr—Thr—Pro—Arg—Asp—Ala—Tyr(TTPRDAY),被认定为是结合到HCC上的序列。与其他癌细胞相比,TTPRDAY特异性的结合到HCC细胞上,并且这种结合也通过免疫荧光得到了确认。另外,合成的TTPRDAY肽在体外对HCC细胞显示出结合活性而没有促进有丝分裂的效应。与非癌性肝组织相比,携有TTPRDAY的噬菌体显示出对来自实际患者标本中的HCC细胞更显著的结合。结论:通过生物筛选技术鉴定的序列TTPRDAY,对HCC细胞显示出显著的结合性。
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